Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZD4Q76G19 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZD4Q76G19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms