Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC149Q6ZUS6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC149Q6ZUS6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms