Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM43BQ6ZT52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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