Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF544Q6NX49 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms