Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX8Q68G74 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms