Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH2Q5VUJ6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms