Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEX3CQ5U5Q3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEX3CQ5U5Q3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms