Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDLRAD1Q5T700 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDLRAD1Q5T700 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms