Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP29Q52LW3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms