Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC39A12Q504Y0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms