Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LONRF3Q496Y0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms