Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBBP7Q16576 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP7Q16576 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms