Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA6Q15825 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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