Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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HERC1Q15751 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
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