Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALX1Q15699 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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