Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABEP1Q15276 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RABEP1Q15276 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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