Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDK1Q15118 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDK1Q15118 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms