Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDC1Q14676 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms