Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCARF1Q14162 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCARF1Q14162 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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