Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX2Q13950 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX2Q13950 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms