Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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