Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXO1Q12778 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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