Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YJL114W	YJL114W	681 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	NME1	NME1	340 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YDL187C	YDL187C	330 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	MMS4	YBR098W	2076 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	NPC2	YDL046W	522 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	SLD5	YDR489W	885 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	IST3	YIR005W	447 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	MRPL24	YMR193W	777 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	KAR1	YNL188W	1302 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	RAD6	YGL058W	519 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	CRG1	YHR209W	876 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	HOT13	YKL084W	351 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YLR252W	YLR252W	306 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YPL080C	YPL080C	327 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YPL197C	YPL197C	414 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	YBR071W	YBR071W	636 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	REF2	YDR195W	1602 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
SMC4	Q12267	RPL42B	YHR141C	321 nt		-0.47	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	RPL42A	YNL162W	321 nt		-0.47	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	FYV10	YIL097W	1551 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YDL009C	YDL009C	324 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	HNT1	YDL125C	477 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YOR169C	YOR169C	465 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	LCD1	YDR499W	2244 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	SPO23	YBR250W	1572 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	ATP15	YPL271W	189 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YOP1	YPR028W	543 nt		-0.51	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	snR8	snR8	190 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	TIM10	YHR005C-A	282 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YJL032W	YJL032W	315 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	PHO80	YOL001W	882 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	ARP9	YMR033W	1404 nt		-0.52	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	ZIP1	YDR285W	2628 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	GEP7	YGL057C	864 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	FAR3	YMR052W	615 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	YBR184W	YBR184W	1572 nt		-0.53	□□□□□ -2.49
SMC4	Q12267	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	RTR2	YDR066C	591 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	SUT2	YPR009W	807 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.54	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YCL002C	YCL002C	792 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	DAD1	YDR016C	285 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	BSC3	YLR465C	309 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YNL150W	YNL150W	408 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YDR344C	YDR344C	444 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	SPO11	YHL022C	1197 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	GOS1	YHL031C	672 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	UPS1	YLR193C	528 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	COX8	YLR395C	237 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	LEE1	YPL054W	906 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	ERV15	YBR210W	429 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	MIC19	YFR011C	513 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	RPS16A	YMR143W	432 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	RRT1	YBL048W	312 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YPR172W	YPR172W	603 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
SMC4	Q12267	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	BET4	YJL031C	984 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YHL042W	YHL042W	453 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	CCE1	YKL011C	1062 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YOL118C	YOL118C	309 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	RFA3	YJL173C	369 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	MUM2	YBR057C	1101 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YDR182W-A	YDR182W-A	204 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	LSO2	YGR169C-A	279 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YKL115C	YKL115C	393 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	snR128	snR128	126 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YBR051W	YBR051W	351 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YNL211C	YNL211C	261 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	YDR029W	YDR029W	315 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	MMS2	YGL087C	414 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SMC4	Q12267	CDC33	YOL139C	642 nt		-0.64	□□□□□ -2.51

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.9 ms