Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSRP1Q08945 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms