Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YBL012CYBL012C 402 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 GCV2YMR189W 3105 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RPA190YOR341W 4995 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 FAR11YNL127W 2862 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 NMD2YHR077C 3270 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YIR044CYIR044C 186 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 HAL9YOL089C 3093 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RGC1YPR115W 3252 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 MGM1YOR211C 2646 nt2.72□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 INP53YOR109W 3324 nt2.71□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 KRE33YNL132W 3171 nt2.71□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 COY1YKL179C 2040 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 MNL2YLR057W 2550 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 CDC53YDL132W 2448 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SIR3YLR442C 2937 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 EDS1YBR033W 2760 nt2.71□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 INP51YIL002C 2841 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 CBF2YGR140W 2871 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 ZRG8YER033C 3231 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SWI5YDR146C 2130 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YGR050CYGR050C 357 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YHL005CYHL005C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 ATG13YPR185W 2217 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 MNE1YOR350C 1992 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YDR186CYDR186C 2634 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 PAU8YAL068C 363 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 PAU18YLL064C 363 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 PAU6YNR076W 363 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 PAU20YOL161C 363 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SET2YJL168C 2202 nt2.69□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YCR043CYCR043C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SRP14YDL092W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 BUD4YJR092W 4344 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 RPO41YFL036W 4056 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SLH1YGR271W 5904 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 EMP24YGL200C 612 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 RPS25BYLR333C 327 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 SLM1YIL105C 2061 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 MSC6YOR354C 2079 nt2.67□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 TFC8YPL007C 1767 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 NUM1YDR150W 8247 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 DYN1YKR054C 12279 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 VMR1YHL035C 4779 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 DBP10YDL031W 2988 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 RPL6AYML073C 531 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 RRP6YOR001W 2202 nt2.66□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 ELG1YOR144C 2376 nt2.65□□□□□ -1.98
AVO1Q08236 YDL196WYDL196W 330 nt2.65□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YFR016CYFR016C 3702 nt2.65□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YME2YMR302C 2553 nt2.65□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 SWR1YDR334W 4545 nt2.64□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 MSB2YGR014W 3921 nt2.64□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 NAM7YMR080C 2916 nt2.63□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 APL5YPL195W 2799 nt2.63□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 BRP1YGL007W 378 nt2.63□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.63□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 NCA2YPR155C 1851 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 PAU3YCR104W 375 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 KTI11YBL071W-A 249 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YCL046WYCL046W 324 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 ENV11YGR071C 2583 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 PMR1YGL167C 2853 nt2.62□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 AMS1YGL156W 3252 nt2.61□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 MRD1YPR112C 2664 nt2.61□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.61□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 PIG1YLR273C 1947 nt2.61□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 TCB2YNL087W 3537 nt2.6□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 RLM1YPL089C 2031 nt2.6□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.6□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 RAD34YDR314C 2079 nt2.6□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 ZRG17YNR039C 1818 nt2.6□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 HSH155YMR288W 2916 nt2.59□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 RIF1YBR275C 5751 nt2.59□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 YDR544CYDR544C 429 nt2.59□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 VPS8YAL002W 3825 nt2.59□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 ATP7YKL016C 525 nt2.59□□□□□ -1.99
AVO1Q08236 NOC3YLR002C 1992 nt2.59□□□□□ -2
AVO1Q08236 ECM29YHL030W 5607 nt2.59□□□□□ -2
AVO1Q08236 HOS4YIL112W 3252 nt2.59□□□□□ -2
AVO1Q08236 CAT2YML042W 2013 nt2.58□□□□□ -2
AVO1Q08236 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.58□□□□□ -2
AVO1Q08236 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.58□□□□□ -2
AVO1Q08236 CYR1YJL005W 6081 nt2.58□□□□□ -2
AVO1Q08236 FIG4YNL325C 2640 nt2.57□□□□□ -2
AVO1Q08236 BPT1YLL015W 4680 nt2.57□□□□□ -2
AVO1Q08236 YGR067CYGR067C 2415 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.1 ms