Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBQ06643 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBQ06643 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBQ06643 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms