Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIN1Q05586 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms