Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE3AQ05086 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms