Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ERCC6Q03468 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERCC6Q03468 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms