Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1BQ00975 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1BQ00975 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms