Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTCQ00610 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTCQ00610 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms