Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2C1P98194 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2C1P98194 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms