Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTD2P86397 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTD2P86397 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTD2P86397 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTD2P86397 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms