Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERVK_113P63132 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HERVK_113P63132 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms