Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMO4P61968 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO4P61968 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms