Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP1P56182 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP1P56182 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRP1P56182 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP1P56182 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRP1P56182 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRP1P56182 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP1P56182 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP1P56182 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP1P56182 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms