Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAG2P55895 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAG2P55895 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms