Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BGRP55822 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3BGRP55822 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms