Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP6P55212 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP6P55212 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP6P55212 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP6P55212 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms