Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	P53189	RRP6	YOR001W	2202 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	SBE22	YHR103W	2559 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	MYO5	YMR109W	3660 nt		3	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	HRD3	YLR207W	2502 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	RSF2	YJR127C	4143 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	YGL182C	YGL182C	324 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	NAM7	YMR080C	2916 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	REC8	YPR007C	2043 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	STB4	YMR019W	2850 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	FYV10	YIL097W	1551 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	RRP5	YMR229C	5190 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	IFH1	YLR223C	3258 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	CHS2	YBR038W	2892 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	YGL063C-A	YGL063C-A	150 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	YKR075W-A	YKR075W-A	270 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	RRP12	YPL012W	3687 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	RIC1	YLR039C	3171 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	SKP2	YNL311C	2292 nt		2.96	□□□□□ -1.93
SCW11	P53189	TFC1	YBR123C	1950 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	CIN8	YEL061C	3003 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	snR76	snR76	109 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	CHO2	YGR157W	2610 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	DUG2	YBR281C	2637 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	CAT2	YML042W	2013 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YMR242W-A	YMR242W-A	90 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	INP52	YNL106C	3552 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	PAU8	YAL068C	363 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	PAU18	YLL064C	363 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	PAU6	YNR076W	363 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	PAU20	YOL161C	363 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	SPO22	YIL073C	2928 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	STT4	YLR305C	5703 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	GCN1	YGL195W	8019 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	RAD4	YER162C	2265 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	INP53	YOR109W	3324 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	TTI1	YKL033W	3117 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	COG6	YNL041C	2520 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	HMI1	YOL095C	2121 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	LRG1	YDL240W	3054 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	SYT1	YPR095C	3681 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	YME2	YMR302C	2553 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SCW11	P53189	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YDR521W	YDR521W	336 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	COX5B	YIL111W	456 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	MNL2	YLR057W	2550 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	TAO3	YIL129C	7131 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	MAD1	YGL086W	2250 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	LHS1	YKL073W	2646 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	CRS5	YOR031W	210 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YOR108C-A	YOR108C-A	210 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	SQS1	YNL224C	2304 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	ZDS2	YML109W	2829 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	MET5	YJR137C	4329 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	KAP123	YER110C	3342 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	MDM1	YML104C	3384 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	ENV11	YGR071C	2583 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	PTP2	YOR208W	2253 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	CRM1	YGR218W	3255 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YLR278C	YLR278C	4026 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	POL2	YNL262W	6669 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	SNC1	YAL030W	354 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	YLR035C-A	YLR035C-A	3468 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SCW11	P53189	AFI1	YOR129C	2682 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	VMR1	YHL035C	4779 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	ZRG8	YER033C	3231 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	STE23	YLR389C	3084 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	YLL020C	YLL020C	306 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	DGR2	YKL121W	2559 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SCW11	P53189	YSP2	YDR326C	4317 nt		2.82	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.1 ms