Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB28P51157 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB28P51157 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB28P51157 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB28P51157 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms