Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GATMP50440 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GATMP50440 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GATMP50440 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GATMP50440 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GATMP50440 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GATMP50440 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GATMP50440 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms