Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VEGFBP49765 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFBP49765 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms