Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK2P49760 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK2P49760 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms