Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP4P49662 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP4P49662 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP4P49662 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP4P49662 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP4P49662 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms