Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCAMP43121 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCAMP43121 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCAMP43121 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCAMP43121 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCAMP43121 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCAMP43121 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCAMP43121 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCAMP43121 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCAMP43121 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCAMP43121 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms