Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIK3CAP42336 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.9 ms