Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 PAU6YNR076W 363 nt2.29□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 ELG1YOR144C 2376 nt2.29□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 TFC8YPL007C 1767 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 PLC1YPL268W 2610 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 LYS14YDR034C 2373 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 CYB5YNL111C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 YCL046WYCL046W 324 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 IRC8YJL051W 2469 nt2.28□□□□□ -2.04
SSZ1P38788 PDR11YIL013C 4236 nt2.28□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 CDC60YPL160W 3273 nt2.27□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 FKS3YMR306W 5358 nt2.27□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.27□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YLR012CYLR012C 300 nt2.27□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 LCD1YDR499W 2244 nt2.27□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 NOP14YDL148C 2433 nt2.26□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YNL028WYNL028W 318 nt2.26□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YDR341CYDR341C 1824 nt2.26□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 RGA1YOR127W 3024 nt2.25□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 snR55snR55 98 nt2.25□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 snR72snR72 98 nt2.25□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 CSE2YNR010W 450 nt2.25□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 VPS8YAL002W 3825 nt2.25□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 PHO91YNR013C 2685 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 DCP2YNL118C 2913 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 SPT21YMR179W 2277 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 SSS1YDR086C 243 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 VIK1YPL253C 1944 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 PET309YLR067C 2898 nt2.24□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 ZRG17YNR039C 1818 nt2.23□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 NAM7YMR080C 2916 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 BRP1YGL007W 378 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 CHC1YGL206C 4962 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 TUS1YLR425W 3924 nt2.22□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 ZIP1YDR285W 2628 nt2.21□□□□□ -2.05
SSZ1P38788 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 COX14YML129C 213 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.21□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SYH1YPL105C 2550 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SGS1YMR190C 4344 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YGL052WYGL052W 306 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YLL032CYLL032C 2478 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YMR045CYMR045C 5268 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 JIP5YPR169W 1479 nt2.2□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 MAK10YEL053C 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SAP185YJL098W 3177 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 MDM20YOL076W 2391 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 RPL37BYDR500C 267 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 RTT101YJL047C 2529 nt2.19□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 RTT107YHR154W 3213 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SPP41YDR464W 4308 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 FKS1YLR342W 5631 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 PAU2YEL049W 363 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 GPG1YGL121C 381 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 INA22YIR024C 651 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.18□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YPR097WYPR097W 3222 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 DNA2YHR164C 4569 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 MSB1YOR188W 3414 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 IES4YOR189W 351 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 UBP1YDL122W 2430 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 TOR2YKL203C 7425 nt2.17□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SAS3YBL052C 2496 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 PDE2YOR360C 1581 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 SRP14YDL092W 441 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YMR321CYMR321C 318 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 YOR015WYOR015W 360 nt2.16□□□□□ -2.06
SSZ1P38788 APQ12YIL040W 417 nt2.15□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YBL012CYBL012C 402 nt2.15□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YOL160WYOL160W 342 nt2.15□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YOR225WYOR225W 330 nt2.15□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 TFC3YAL001C 3483 nt2.15□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 NPR2YEL062W 1848 nt2.14□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 PFD1YJL179W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 GCN2YDR283C 4980 nt2.14□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 YCK3YER123W 1575 nt2.14□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 IRE1YHR079C 3348 nt2.14□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 MPT5YGL178W 2580 nt2.13□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 KOG1YHR186C 4674 nt2.13□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 NUP170YBL079W 4509 nt2.13□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 ZIP2YGL249W 2115 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 HMI1YOL095C 2121 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 UBP2YOR124C 3819 nt2.12□□□□□ -2.07
SSZ1P38788 CTR9YOL145C 3234 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms