Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHI3L1P36222 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms