Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA3P32297 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms